在错合畸形的发生和发展中，口腔不良习惯是一个重要原因，例如吐舌、咬舌、咬唇、咬笔，口呼吸，吮指等等都可能引起特定类型的错牙合畸形。矫治错牙合畸形的同时去除这些不良习惯，也就去除了病因，可以起到标本兼治，防止反复的作用。对于年龄尚小，不良习惯持续较短的患者，单纯去除不良习惯，有些错牙合畸形可以自行消失，恢复正常。而对于年龄较大，不良习惯持续较长的错牙合，在去除了不良习惯后往往还需要矫治器对错牙合进行矫治。不良习惯的矫治强调及时发现，及时处理。应当使用暗示的方式进行疏导而避免随意呵斥，给予儿童适当的提醒，若仍然不能克服，则需要医生进行干涉，为儿童佩戴破除不良习惯的矫治器。